醫藥冷庫又稱醫療冷庫，醫藥冷庫主要用于在常溫條件下無法長期保質的各種藥品、疫苗、血液、血漿、藥劑、試劑、生物制品等醫藥用品的儲存。不同的醫藥產品，所需的貯藏溫度是不同的，一般醫藥冷庫具體又分為：疫苗庫、藥品庫、血液儲存庫、低溫保溫庫、超低溫保存庫等。
疫苗冷庫：疫苗儲存是一項很重要的工作，各類疫苗均有相應的貯存溫度和保存條件，若疫苗保存不當，常常會導致疫苗效能降低，甚至失效。弱毒凍干苗一般應低溫保存，濕苗則應低溫凍結保存，滅活苗應保存于2～8℃，溫度過高會引起油佐劑苗的油、水分層，甚至發霉變質，導致抗原性喪失，油佐劑滅活苗、組織滅活苗，鋁佐劑苗均不能凍結，否則會破乳，產生凝集塊，影響疫苗接種效果。因此，疫苗冷庫設計需符合GSP疫苗冷庫設計標準、《冷庫設計規范》、《制冷設備、空氣分離設備安裝工程施工及驗收規范》GB50274-2010等技術規范要求。
血液儲存庫：儲存血液的冷庫，全血和紅細胞懸液的儲存溫度多為2~6℃，血小板的儲存和運輸溫度是20~24℃，普通冰凍血漿的儲存溫度是零下18℃及以下；
藥品冷庫：一般溫度設定在0-20℃之間，相對濕度控制在45%~75%之間，需避免陽光直射，可用于儲存在常溫下不可長期儲存但又不需要太低溫環境下儲存的各類藥品和生物制品等；
低溫保溫庫：-20以下，可用于保存血漿、生物材料、疫苗、試劑等；
超低溫保存庫：-20~-80，可用于保存血漿，干細胞，骨髓，生物樣品等。
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